1. 主线剧情：艾达一直为西蒙斯工作，但逐渐对他的人品产生了怀疑，并最终离开了他。西蒙斯对艾达的离开感到伤心，并决定利用C病毒克隆艾达。卡拉，由于被西蒙斯信任，成为了克隆艾达的DNA来源。然而，卡拉被改造后逐渐恢复了意识，并开始报复西蒙斯。在一场混战中，里昂和艾达最终合力消灭了西蒙斯。

2. 里昂和海伦娜的故事：在美国高橡树市，发生了一场生化袭击，里昂不得不杀死已经变异的总统。之后，里昂和海伦娜一起调查事件的真相，并最终前往中国。在中国，他们遇到了杰克和雪莉，以及克里斯和皮尔斯。在一系列战斗后，他们成功击败了西蒙斯，并利用杰克的血液制作出了C病毒抗体。

3. 克里斯和皮尔斯的故事：在病毒爆发半年前，克里斯和皮尔斯在东欧执行任务时被卡拉陷害，导致克里斯失去记忆。半年后，克里斯恢复记忆，并决定为正义而战。他们最终成功拦截了病毒导弹，但在战斗中皮尔斯失去了右手。皮尔斯在海底研究所中使用强化C病毒让自己复活，并与克里斯一起击败了混沌丧尸。最后，克里斯继续执行任务，而皮尔斯留在海底研究所。

4. 杰克和雪莉的故事：杰克和雪莉在半年前遭遇空难，并在逃跑过程中不断遭遇卡拉派遣的抓捕者。最终，他们成功逃脱并遇到了里昂和海伦娜。在战斗中，杰克发现雪莉拥有病毒抗体，使她成为了“超人妹子”。最后，杰克和雪莉分道扬镳，杰克骑着摩托离开，而雪莉在飞机上收到了他的短信。

5. 艾达的故事：艾达接到西蒙斯的命令前往潜艇调查，并发现命令是半年前发出的。之后，她得知美国和中国将遭生化袭击，并开始调查真相。在过程中，她解救了杰克组，并最终在新安布雷拉的海上军舰上销毁了所有数据。艾达在离开时接到新的任务。

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