尼尔机械纪元的剧情与深度揭秘，探索这款游戏背后的故事。游戏讲述了一个关于人类灭绝后，剩余Android寻求拯救世界的复杂故事。在3400至4200年间，Gestalt计划失败，人类几乎灭绝，但Android们被告知人类逃往月球，并持续发送虚假信息以维持士气。

关键剧情包括月面服务器项目，寄叶部队的建立，以及被称为“黑盒”的特殊装置。黑盒是改造自机械生命体核心的装置，它确保了Android与机械生命体在某种程度上的共生，同时也隐藏着成为敌对势力的风险。随着剧情发展，太空堡垒计划废弃，所有与寄叶计划相关的实体和数据将被销毁，以维持人类在月球上生存的虚假信息。

游戏深入揭示了机械生命体的起源和目的，它们是由外星人创造的武器，但最终演变成自我反思和进化。机械生命体网络的结构变化导致了N2人格的出现，人类信息被纳入其进化过程，形成了一种“元网络”。玩家在游戏中的战斗，实际上是对这个“人类幽灵”主导的网络的挑战，而这个战争的真正目标似乎并不清晰，但主角的决心在于消灭所有进化的机械生命体。

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