在《神雕侠侣》中，仍在小说扮演举足轻重的角色。此时黄蓉已是一位成熟的贤妻良母，又是足智多谋、武功高强、精通五行八卦阵和奇门遁甲之术的「女中诸葛」；可说是身兼东邪和北丐两家绝技的高手，而且多年来和丈夫郭靖一起助守南宋的军事重镇襄阳以抵抗蒙古大军的侵略因而受到中原武林群雄的敬重。

　　黄蓉有感於杨康乃阴险奸诈、卖国求荣的小人，故而对其儿子杨过也多番猜疑并一直处处提防直至获杨过多番相救後才算冰释前嫌。黄蓉在此本小说有一半的时间正在怀孕，令她未能发挥应有的武学功力；其间遇上武功绝顶的强敌金轮国师，获杨过屡次相助加上本身智慧才得以脱险。在产後不久、还未恢复十成功力之时，使出兰花拂穴手配合落英神剑掌便足以制服赤炼仙子李莫愁、力战绝情谷谷主公孙止；和凭真功夫成功用口接住铁掌莲花裘千尺的厉害杀著「枣核钉，黄蓉武功之高於此可见一斑。

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