这一作的操作方法与第二代基本相同，唯一要注意的一点就是这一代的管制对话相较于第二代来说要慢一些，插话现象也尤其严重：许多请求命令会一起报出，中间根本不留给玩家进行管制的机会。这也就在无意中增加了游戏的难度，但是，相对于二代来说，还是有些较为人性化的改进，比如说引发压力（stress）值上升的时间（怠慢时间）有所延长，起飞的飞机中途短暂停止滑行时，压力值不会上升，降落的飞机地面短暂停止滑行时，压力值虽然不会立刻上升，但是由于中途停止滑行时间过长而导致飞机晚点15分钟进入停机坪时，压力值会上升。手动给予“复飞”指令时，压力值不会上升，但是由于跑道问题（风向错误，除雪作业进行）未及时给予着陆指令而导致飞机自动复飞，以及因为给予复飞指令而造成飞机晚点进入停机坪时，压力值还是会上升。

特别需要一提的是大阪伊丹机场中TBA航空的出现往往代表着事故的发生，例如货舱着火，起落架故障，滑入草坪，进入错误的滑行道等等。这时就需要特别注意滑行道和停机位的分配。

过关与失败的条件与二代基本相同，只是得分必须要达到关卡规定的分数才能够通关，（不同于二代，在三代中压力奖励得分是不会自动补足剩余分数的），另外在成田Night Wings一作中，飞机误入封闭维护的滑行道会直接导致游戏失败，失败原因为“No Enter”。

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